藍羽財団のＣＥＯであるルリが、逮捕された。学校を取り囲む、取材陣たち。
いてもたってもいられないアルマは学校を抜け出すと、財団を解散してきたという鏡と合流する。
何者かが藍羽財団に攻撃を仕掛けてきたというのだ。屋敷からは、アオイまでがさらわれていた。
ルリの行方を捜すふたりを、研美研究所の兵士たちが襲う。
一方、研美の研究所では、研美がルリの体に眠るセイクリッドセブンの「コア」を取り出そうとしていた。
折しも、研美との因縁に決着をつけようとするナイトが研究所を襲撃。
アルマと鏡もルリ救出のために駆けつけ、研美研究所を舞台に、自体は混戦の様相を呈していく。
ルリ救出のため、研美研究所に突入していくアルマ、鏡、メイドたち。
鏡の操るエンゲージメントスーツの前にはアーティジェムスーツを纏ったＳＰが立ちはだかり、
フェイの道案内でルリの元に急ぐアルマの前には、悪石人間「0号」が現れる。
ナイトの応戦に救われる形になったアルマは倉庫の中で、失くしたはずのペンダントを見つける。
ナイトと０号の闘いの中、フェイは兄である０号を血清で救いたいとナイトに懇願するのだった。
ようやくルリの元にたどり着いたアルマ。しかし、ルリは結晶に包まれ、近づくことができない。
今度は自分がルリを救うため、ペンダントの力を渡そうと渾身の力でルリへと手を伸ばすアルマ。
そのとき、幼い頃の記憶が蘇る。セイクリッドセブンの力を使い、ルリの命を救ったことを…。
無事ルリを助け出すアルマ。
すべての真実を明かした研美は、フェイの兄である0号の心臓を貫くと、その暴走したエネルギーを自身に取り込んでしまう。
兄を殺されたフェイの悲痛な叫び。
呆然と見つめるアルマ、ルリ、ナイトの前で、狂気に満ちた研美の哄笑が響き渡るのだった。
